表型生物胁迫在植物与病原体相互作用钻研中时时受到表型的故障，而这些表型很难通过视觉评估来分辨。出格是毒力因子中的单基因突变体可能不足显著的表型。叶绿素荧光(CF)成像是监测植物与病原体相互作用的沉要工具。然而，只管能够丈量很多CF参数，但有关植物与病原体相互作用的钻研通常集中在数量有限的参数上。它可能导致在视觉上分辨类似表型的能力有限。

本钻研中，作者评估了多个CF参数组合改善此类表型的能力。这种步骤可能有助于在事先不知情的情况下筛选和甄别细菌毒性因子的影响。本文基于多个CF参数的组合，开发了一种无需选择任何参数的推算步骤。涉及直方图巴氏距离推算和分层聚类，以及思考叶间和表型内异质性的尺度化步骤。

3 dpi时叶片间异质性的观察

为了评估该步骤的有效性，用同样的步骤分析了两个数据集。第一个数据集拥有黄单胞菌菌株的单基因突变体，仅其排泄细菌毒力蛋白的能力分歧。该数据集在接种后6天显示了预期的表型，并用作成立步骤的根基真实数据集。接种后3天表型的有关甄别证了然该推算步骤的有效性。第二个数据集是由3型效应子的瞬时表白(agrotransformation)组成的。第二个数据集显示的表型无法通过视觉评估加以分辨，并且无法事先相始种3型效应器对叶片组织的影响。利用该推算步骤，凭据3型效应器对叶片样本进行聚类，从而提高了对视觉类似表型的鉴别能力。仅由一种毒力因子分歧的细菌菌株诱导的视觉类似表型的有关分辨说了然使用CF参数组合来监测植物与病原体相互作用的沉要性。它为鉴定生物胁迫的特定特点启发了远景。

两种分歧试验应变之间距离的推算步骤

凭据70张CF参数图像的组合对第二个数据集的样本进行聚类

起源：Front. Plant Sci.A Computation Method Based on the Combination of Chlorophyll Fluorescence Parameters to Improve the Discrimination of Visually Similar Phenotypes Induced by Bacterial Virulence Factors.Valérian Méline, Chrystelle Brin, Guillaume Lebreton, Lydie Ledroit, Daniel Sochard, Gilles Hunault, Tristan Boureau and Etienne Belin.https://doi.org/10.3389/fpls.2020.00213