EZ-Root-VIS:用于根系结构急剧分析和可视化沉建的软件
- 行业动态
- 2018-09-03 15:10
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【概要描述】本文作者开发了Root-VIS,一款免费的软件工具,能够在用户选择的根映像集中援手确定很多RSA个性的均值和方差。此表,Root-VIS提供了几种选项,能够凭据均匀数据天生根系统的可视化沉建,从而实现筛选和建模。
EZ-Root-VIS:用于根系结构急剧分析和可视化沉建的软件
【概要描述】本文作者开发了Root-VIS,一款免费的软件工具,能够在用户选择的根映像集中援手确定很多RSA个性的均值和方差。此表,Root-VIS提供了几种选项,能够凭据均匀数据天生根系统的可视化沉建,从而实现筛选和建模。
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- 颁布功夫:2018-09-03 15:10
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若是我们想要相识环境若何塑造生物的表观和行为,我们必要比力分歧基因组成和环境经验的个别群体。对于复杂的表型特点,如人体的姿势或面部表情,比力并不单一,由于一些影响成分无法等闲地在个别间量化或均匀。因而, 用推算步骤来沉建拥有代表性的原型, 使用一系列的算法来添补缺失信息和推算伎俩。同样的问题也合用于植物的根系统系统结构 (RSA)。一些推算机法式可用于从根图像中提取数值数据, 但通常不提供自界说的数据分析或 RSA 的可视化沉建。

EZ-Root-VIS综述
本文作者开发了Root-VIS,一款免费的软件工具,能够在用户选择的根映像集中援手确定很多RSA个性的均值和方差。此表,Root-VIS提供了几种选项,能够凭据均匀数据天生根系统的可视化沉建,从而实现筛选和建模。作者通过对拟南芥(Arabidopsis thaliana)的全基因组关联钻研证实了Root-VIS与新版EZ-Rhizo的合用性,可用于急剧表征基因型-环境相互作用和基因发现。

拟南芥在分歧营养前提下的RSA性状

全基因组关联钻研的根系结构特点
起源:Plant Physiology.EZ-Root-VIS: A Software Pipeline for the Rapid Analysis and Visual Reconstruction of Root System Architecture.Zaigham Shahzad, Fabian Kellermeier, Emily M. Armstrong, Simon Rogers, Guillaume Lobet, Anna Amtmann, Adrian Hills.